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邓玉函不自觉的对大明皇帝提高声音，让金尼阁也吓了一跳。这里可是大明，不是有个城堡就能敢自称王候的欧洲。在欧洲就算是国王，他的权力也大约只在宫廷之内，更别提还有在王权之上的罗马教廷。
欧洲的国王不管再这么蛮横，也不敢得罪教廷的人员，因为教廷掌握着最后的终极武器，就是革除教门。
德意志国王和神圣罗马帝国皇帝亨利四世是一位强权君主，但是因为与教皇格里高利七世在主教任命权上发生了争执，当时教皇主张两人谈判，他竟然置之不理并宣布废黜教皇，教皇于是针锋相对，宣布解除臣民对亨利四世的效忠誓约，革除其教籍。
结果看似欧洲最强大的君主，一夜之间他的王国就叛乱四起，眼看着自己的国家就要有覆亡的危机，亨利四世不得不在寒冬腊月，穿成罪人的打扮,赤足,披着毡衣,领着妻子在教皇所驻的卡诺莎城堡外跪在雪地里哀求了三天三夜,请求教皇原谅。
所以在欧洲，耶稣会的教士们并不用惧怕王权。但是在这里，只要皇帝做个暗示，耶稣会就会再次被赶出大明的地界。
金尼阁正想着为邓玉函从中说情时，却见崇祯毫不在意，反而兴致勃勃的关心起邓玉函本人，及他那些在欧洲出名的朋友起来了。
金尼阁心中一动，暗暗想着，“看起来这位大明皇帝，对欧洲的著名学者很感兴趣呢？”
邓玉函可不是金尼阁这样的宗教虔信者，为了把上帝的福音传播到东方，才加入耶稣会的。
从本质上来说，他是一个科学家，虽然在欧洲人们都称赞他在医学、天文学和植物学上的成就。但是邓玉函自己心里很清楚，他研究天文学，是为了掩盖研究医学带来的不利名声。
麦哲伦完成环球航行之后，标准这大航海时代的到来。而在茫茫大海中如何定位船只就成了一个难题，为了追求海外贸易带来的巨大财富，欧洲各个王侯都不遗余力的支持着任何关于航海技术的研究。
欧洲学者在数十年的研究之后发现，想要解决海上定位的问题，最好的解决办法，是研究头上的星星。于是天文学从一门占卜算命的学科，几乎一夜之间就成了欧洲最流行的显学。
天文学家，也就成了这个时代欧洲第一流学者的代名词。而与之相比的欧洲医学，还处在兼职屠夫的愚昧阶段。而最为不利的是，虽然在天文学的发展下，欧洲的教权开始逐渐衰落，但是这个时代的宗教裁判所并没有闭上自己的眼睛。
邓玉函显然不想因为研究医学和植物，最后被宗教裁判所当成巫师烧死。所以他在研究医学的同时，同样研究天文学，为自己披上了一身华丽的外衣。
当邓玉函在日耳曼声名鹊起的时候，他发觉如果继续在欧洲研究他的人体解剖学，就算是天文学家的名头也照样保不住他。于是他主动加入了耶稣会，前往宗教裁判所看不到的东方研究他所热爱的医学。
虽然朱由检不知道猞猁科学院、灵采研究院的院士意味着什么，但是伽利略也同在其中，这说明了在他眼前的是一位同伽利略不分上下的科学家。
对朱由检来说，在这个时代，能遇到这样的人，这实在是一种幸福。和徐光启这些半路出家的儒家学者不同，邓玉函是一个接受过欧洲完整的自然科学体系教育的科学家，而这一点弥足珍贵。
自然科学之所以在后世被冠以西学，就是因为西方先于东方完成了近代自然科学体系的建立。可以说仅仅在文艺复兴之前，东西方都是在自然科学的黑暗世界中毫无方向的摸索着，就算有所收获，也不过是一颗颗散落在黑暗中的珍珠。
而文艺复兴之后，怀疑一切，质疑一切的西方近代科学研究的思想开始逐步形成。在这种思想的穿导下，原本前人只鳞片抓的自然科学发现，被连接成了一个严谨的科学体系。
而中国则因为过于成熟的社会伦理思想，导致了自身的自然科学研究始终未能更近一步，成为一个完整的科学体系。即便是如徐光启这样的大科学家，也把注意力放在了制造器具的技艺上，而未能开创出指导中国自然科学研究的方法论。
听的时间久了，邓玉函浓重的口音，也让朱由检慢慢觉得淡下去了。听完了邓玉函关于欧洲学者们，及他们所发表的各种学说的介绍后。
朱由检有些冲动的问道：“如果朕请邓先生替我邀请这些学者来大明做研究，他们会来吗？”
邓玉函楞了一下，有些犹豫的说道：“尊敬的皇帝陛下，虽然现在从欧洲到东方的航行，已经不像几十年前那么困难了。但是对大多数人来说，远洋航行始终是一场看不到结局的旅行。
在我的家乡，每次有人做远渡大洋的航行时，都会提前为他举行一次弥撒，寓意是如果不幸在旅途中出了意外，也算是提前举行了葬礼了。
老实说，我真不能像皇帝您保证，他们会接受您的邀请，前来东方。不过我可以试着替您邀请我的两位好朋友，开普勒先生和伽利略先生，不过我希望皇帝您别抱太大希望。”
朱由检微微有些失落，不过他马上振奋了精神说道：“罗马教皇派遣了耶稣会，向大明展示了友谊。作为大明的皇帝，我希望能派人前往欧洲，对教廷做一次回访，以表示朕的友谊。
当然今年的季风是赶不上了，而且准备送给教皇冕下的礼物也需要准备，不过我希望可以在明年成行。不知道金尼阁先生，能否为朕联系前往欧洲的商船呢？”
崇祯的话顿时让金尼阁大为兴奋，这简直是他踏上这片土地以来，听到过的最动听的话语。
金尼阁压抑住自己的兴奋，尽量平静的说道：“如您所愿，尊敬的陛下。耶稣会一定会为您准备好最坚固的船只，和最有经验的水手，让陛下您的礼物，完整无缺的出现在教皇冕下的面前。”
朱由检微笑着对金尼阁点了点头，他决定再给这些中国耶稣会的传教士们一些甜头，好让他们接下去更有干劲的工作。
“你们既然来到了京城，为朕做事。那么朕也不打算亏待你们，利玛窦先生在正阳门内洪武岗西崇礼街上建立的教堂，朕会下令发还给耶稣会。”朱由检轻声细语的对着面前的三人说道。
大明皇帝的善意，让金尼阁和邓玉函都显得很高兴，金尼阁完全没想到，才到京城没多久，耶稣会就取回了自己的教堂，这简直比他进京前所预想的最好前景还要美妙。
金尼阁在兴奋之余，突然向起来一件事，他从袖子内取出了一份折叠好的目录，呈给崇祯后说道：“尊敬的陛下，这是我和几位耶稣会的教士，在这些天赶录出来的书籍名录的一部分。这里大约有300多部书籍，除了书目之外还有简单的内容介绍，请陛下过目之后，挑选一些合用的书籍出来，我们好优先翻译出来。”
朱由检略略的翻看了几页，这些耶稣会的教士似乎并没有把书籍分类，只是按照时间顺序排列了下来，因此虽然目录上记载了大约不到200余本书目，但是已经看到朱由检头晕眼花了。
匆匆扫过几眼之后，朱由检合上了目录，然后对着金尼阁说道：“我觉得不必着急忙着翻译，金先生还是先把所有的书籍按照法律、艺术、哲学、物理、化学、数学等门类，分门别类的整理好，编制出一套索引先。很快我就会挑选一些好学上进的年轻人给你，让他们跟着你学习这些语言文字，并翻译这些书籍。朕现在最想要翻译出来的，是关于欧洲商业法律上的书籍，如果金先生这次携带的书籍中有这些内容，请优先翻译出来。”
金尼阁严肃的点了点头，向崇祯保证道：“陛下的书籍分类方式很别致，我相信我们很快就能编制出陛下想要的书籍索引，至于法律上的书籍，如果我没有记错的话，我携带的书籍中应该会有这样的内容。”
站在另一边的邓玉函有些忍耐不住的询问道：“尊敬的陛下，不知道您打算什么时候开始编制新的历法呢？我非常希望能尽快的投入到这项工作中去。”
朱由检看着邓玉函微笑着说道：“邓先生不用这么着急，我们中国有句名言：工欲善其事，必先利其器。在修订历法之前，朕希望徐先生和诸位能够重新制定大明的度量衡。
今天的大明，不要说北方和南方的度量衡有出入，就是同在京城，城东的粮食铺子和城西的粮食铺子，他们所用的量斗都有出入。
以这样粗糙的度量衡，又怎么能计算出精确的历法来呢？而且重量、长度、体积的单位混乱，三种物理单位之间的换算繁难复杂，这完全不符合大明作为中央之国的地位…”
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