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从训练开始，王启知道在自己没有在身体素质训练之前，晚上的活动估计是要无限期延后了，毕竟要保证明天下午，必须有充足的精神接受训练。
早上的看书时间，王启并不打算占用看书的时间，同时早上头脑更清醒，是王启整理前世知识，并且展开闹洞思考更多能够让查克拉和地球上知识相结合的方案，这些王启看来更重要一些，比身体素质训练更重要。
而随着王启身体素质逐渐提高，王启的训练项目日益繁多，对体力要求越来越高，在很长一段时间里，王启每天回到家基本上是倒头就睡。
王启的作息时间变得更加规律起来，早上看书展开想象，下午强度极高的体能训练，而随着训练的继续深入进行，一些简单的基础动作加入到王启的训练中来，不过多是训练用和打基础的，并不具备实战价值。
这样的日子，持续了一年多的时间，再过三个月王启便满五岁了，而再这一年中王启的身体开始飞速成长，1米2出头的身高，让他看上去一点也不像一个不满5岁的孩子。
在训练期间五项身体素质都在八神拓也的安排下，进行了合理的练习，凭借王启在穿越前的那点准备，二流的专业知识加上三流的眼光，“穿越人事具有开阔的眼界，所以能够怎么怎么样”，这样的牛逼姿态根本就没有。
并且王启查克拉锻炼在四个月前，接受了八神拓也的第一阶段教导下，让王启在晚上也有了训练项目，并且有了长足的进步，这种进步是各个方面的，不过进步最深的是在对查克拉的“认识”上！
而且更多的是与王启自己的努力有关，而非八神拓也的教导。
不过随着“认识”的加深，王启越发感觉到自己的不足，一种来自深处的匮乏。
在四个月前，随着王启的身体素质越来越好，八神拓也开始正式教导王启查克拉修炼，然而在教导中王启发现，现今忍界对于查克拉的认识，和漫画中表现的一般无二。
在王启来看火影世界中大多数人，学习忍术都是照本宣科、不求甚解，通过大量的练习来掌握忍术，而不是了解其本质之后再来学习他的应用。
在这个世界中应用数学有一定发展，但也是相对有限，而基础数学则是无人问津。
以科学的方法了解这个世界，以大蛇丸为代表的这类人物，也受限于时代、文化、知识、思维等原因，还未曾踏足微观世界，原子与分子的世界。
他们用赖以生存的查克拉，开发出了一个个忍术，从易到南，从攻击到防守，从单一到全面，甚至涉及到了空间、精神、灵魂、鬼神等等，却极少涉及到民生、社会发展上，也没有给查克拉制定一个最基本、能够通用的单位。
并且在王启观察和阅读中发现，很多与查克拉基础有关资料都包含了作者的主观意向，并且从八神拓也哪里得到的信息，再结合漫画，王启发现忍者进行教学的时候，都带有极为明显与强烈的个人经主义。
科研最难的不是研究，而是确立一个方向，这个方向要可行，并且对自己提升实力有着足够的帮助，最还还足够重要，有巨大的开发潜力。
首先确定要求：能够有效增强自己的实力，并且还需有可行性，自己有限的知识起码能够做出一定解释，让自己去运用。
比如，自己穿越了身体也没有了，为什么还会有记忆这种问题，基本上没可能自己给出答案。
为此王启足足花了两天时间来确定研究方向，带着实验性的定为：为什么自己能够指挥查克拉？
再这个方向的指导下，王启运用归纳法和演绎法对这些现象进行总结，总结出两种猜想：
第一种:查克拉的组成由“身体能量”和“精神能量”两种“能量”构成，那么这两种“能量”会不会是自己能够操控查克拉的原因。
第二种：人体身体的活动都是由，大脑神经元产生的电信号所控制，那么查克拉会不会也是如此。
不过要解决两种种猜想，都首先需要去探寻，精神能量、身体能量与查克拉三种物质的本质，在来解决它们之间可能存在的联系。
那么第一个需要攻克的难关来了！
“查克拉是什么？”
王启最终在定下这个方向时，也是极为犹豫，因为这个东西太难以琢磨了，不过最终王启还是定了下来，至于为什么，就连王启自己也不确定。
王启没有高精尖的仪器进行分析，不过哪怕是有王启估计也是不会用，至于自己造，观察原子的仪器，还是算了吧。
因此王启只能进行最粗浅的实验，在结合自己那浅薄的知识去尽可能理解，不过王启有一个优点，同时在地球的时候也被大数据时代所强化过，那就是他的思维非常活跃、开阔，也就是现在人们俗称的脑洞。
然而有脑洞是不够的，王启不停的使用查克拉，不停的去实验去触摸、传递、隔绝、对比，将查克拉能够产生的现象，尽可能的表现出来。
在实验中，王启找到了一个比较靠谱的查克拉单位，王启是这样定义：一度查克拉：1克蒸馏水每提升1度，查克拉所消耗的量。
而这次测定因为条件有限，王启也知道也不是特别准确，但是条件如此，王启也无法苛求更多，而且在这个截断的实验中其实是够用了。
而且在确定了单位之后，王启按照如此的量进行分隔练习，能明显的感觉到自己查克拉控制能力的提升速度明显加快，而王启查克拉控制分为三个方面：量、操控与感知。
操控：驱使不同单位的查克拉进行各种各样的变化、移动、传递等。
感知：与查克拉联系的强弱，王启发现当查克拉离开身体后，这种联系在迅速削弱，并且与距离成正比，随着距离增大，这种感知也越弱。
同时，王启也发现查克拉很符合逻辑的现象，操控与感知，与查克拉的量成反比，量越多控制的难度也越大。
在确定单位之后，王启在接下来不停实验中，终于有了突破。
现在，王启看着两只手和一旁的两个水碗，两个水碗温度有着明显的差异，仿佛抓到什么一般，不停的重复实验并且记录，同时王启自言自语道：“第五次实验，4度基础水温，都是50度的查克拉与100克的水，查克拉控制没有出现大的差别，这方面的影响应该可以忽略不计。”
“水震动剧烈的碗温度更低，在2度。水震动弱的碗温度更高，在4度。考虑到温度计反映需要时间与实验误差，那么水温差应该更大。”
“没有测试震动幅度的办法，不能定量的进行检测，那么定性方面……”
王启放下笔，翻阅着记录本前面的实验记录，一遍自言自语道：“单纯的查克拉，不考虑属性变化，不考虑忍术。查克拉可以让火焰燃烧更剧烈，可以让铁棒升温，可以让树叶中的水分升腾、可以对物体施加压力等等，让查克拉作为能量源的运用方式。”
王启最后合上记录本，皱着眉头不太确定的说道：“套用热力学第二定律涉及到能量与熵的变化，既然查克拉可以让水升温，即增大水的能量与熵值，查克拉可以看做热源吗？”
“而热能上的变化，则是我刻意让其转化为动能，所有的实验都是如此。”
“查克拉体现出非同一般的共性，可以直接转化为各种形式的能量体现，动能、内能、机械类、生物能等等。”
“而且，查克拉无法长时间的保存，从制造开始后便会开始流逝，流逝的能量大部分重新回到身体中，补充体能和精神，一小部分逸散到外界，极为活跃，彷佛能够进入任何物质。”
“那么它是什么？”
“根据能量守恒定律，能量是守恒的，哪怕是所谓的质能方程，也只是通过原子核的裂变、聚变等释放更多的能量，而不是把物质转变为能量，能量只能有由能量变为能量。”
“而查克拉可以转化为现在我知道的所有形式能力，并且不需要借助其它东西，那么……，它是纯能量？！”